发表于2012年第8期《中华预防医学杂志》上的一项研究发现,河南省郑州市男男性行为人群HIV-1流行株亚型分布较复杂,重组型毒株已成为优势流行株。
研究于2011年3~4月采集郑州市30例男男男性为HIV-1感染者的血样,应用逆转录及套式PCR方法扩增HIV-1 gp41基因并进行测序,应用BioEdit软件对序列进行校对编辑,应用美国洛斯阿拉莫斯国家实验室HIV核酸序列库和美国国立生物技术信息中心提供的在线分析工具进行比对分析,确定其基因亚型,应用MEGA3.1软件构建系统进化树,并对不同亚型gp41基因扩增区的基因离散率进行分析。
结果在30例男男性行为HIV-1感染者的血样中,共获得18个HIV-1 gp41基因序列,分别为CRF15-01B[50%(9/18)]亚型、CRF01-AE亚型[22﹪(4/18)]、CRF07-BC亚型[22﹪(4/18)]和B亚型[6%(1/18)]。各亚型毒株均与各自的参考株聚集,CRF15-01B、CRF01-AE、CRF07-BC亚型的组内基因离散率分别为(0.050±0.007)、(0.052±0.009)和(0.082±0.012)。