全球基金是建立在一整套原则的基础之上的，这些原则是我们一切工作的指南--从机构治理到进行赠款都是如此：

• 以金融组织而不是执行实体的身份进行运作。
• 筹募和调节增加的财政资源
• 支持反映国家所有权的计划。
• 在不同的地区、疾病和干预活动保持平衡运作
• 寻求综合平衡的 预防和治疗方案。
• 通过独立的审核程序来评估赠款项目申请
• 建立一个简化、快速和创新的赠款程序，实行透明作业，切实负责

　　以金融组织而不是执行实体的身份进行活动。
　　全球基金的目的在于吸引、管理和拨付资源来抗击艾滋病、结核和疟疾。我们不直接执行计划，而是依靠地方专家来执行。
作为一个金融机构，全球基金与其它参与卫生和发展问题的多边和双边组织紧密合作，确保新的资助项目与原有项目协调发展。在很多情况下，这些合作者参与地方的国家协调委员会，在准备申请和执行计划的过程中提供重要的技术支持。
　　全球基金致力于尽可能地依靠已有的财政管理、监控和汇报系统。

　　筹募和调节增加的财政资源。
　　全球基金只资助那些经确认不会代替或缩减其它资金来源的艾滋病、结核和疟疾抗击计划或更广泛地支持公共卫生的计划。全球基金积极寻求补充其它捐赠方的捐赠资金并使用它自己的赠款来促进捐赠方和受赠方自己的进一步投资。在一些国家，政府或其它组织已经增加了它们对抗击这三种疾病的计划的支持，肯定了全球基金全面增加卫生投资的抱负。
　　自2001年以来，全球基金已经吸引了47亿美元，用于资助到2008年的计划。在起初的两轮捐赠中，全球基金已经承诺为全世界93个国家的154个项目提供资金支持
　　如此大量资源的注入能使许多国家现有计划的规模扩大到与需求相当的水平。另外其它资源将有助于因资金严重缺乏而无任何计划的地区启动新的计划。在未来的几年内，全球基金支持有效干预行动进行扩展的能力将完全取决于它进一步筹集资金的能力。

　　支持反映国家所有权的计划
　　全球基金鼓励在受赠国家内发展合作者之间的新联盟，并寻求当地群众团体和私营部门代表的积极参与。全球基金主要关注申请的技术质量，同时将计划设计和确定优先问题工作留给由国家协调委员会代表的合作伙伴，同时还鼓励地方所有权。
　　这种方法不但能有效促进具体疾病防治策略，而且还支持受赠国家加强基本卫生系统的努力，与国家策略计划达成一致。全球基金批准的计划建立在已有的扶贫计划和已制定的部门公共卫生改善方案之上。

　　不同的地区、疾病和干预活动保持平衡运作
　　在分配赠款时，全球基金优先考虑来自抗疫资金最匮乏、疾病负担最严重、最需要帮助的国家和地区。为避免发生进一步的灾难，全球基金会支持对世界上出现新发流行病的地区进行捐赠。例如，帮助乌克兰建立HIV抗逆转录病毒治疗系统的捐赠，使得政府和非政府组织之间通过全新的合作关系明显扩大了治疗规模。
　　全球基金为世界所有地区的项目筹集资金。然而，考虑到这些疾病在非洲的严重影响，第1轮和第2轮批准的大部分资金都被用于资助非洲撒哈拉沙漠以南地区的资助计划了。此两轮批准的将近三分之二的资金都用于抗击艾滋病。  

　　寻求综合平衡的预防和治疗方案
　　全球基金提供抗击艾滋病、结核和疟疾的综合方案，根据地方决定的需求资助预防和治疗计划。四分之三的接受抗艾滋病捐赠的国家都至少将一部分赠款用于提供抗逆转录酶病毒治疗。所有的抗艾滋病赠款项目都包括预防活动，并且大多集中在占全世界新增感染者40%的青少年患者身上。抗疟疾赠款既帮助人们获得更多的防虫蚊帐，同时也给卫生官员提供工具和识别、诊断及医治病人的培训。至于结核病，提供有效的治疗对于预防疾病的进一步扩散尤为重要。

　　通过独立的审核程序来评估赠款项目申请。
　　全球基金利用独立的技术审核小组确保有限的资源流向技术上最适当的项目，从而获取最大的成功机会。该小组包括疾病专家和区域发展专家，负责评估申请的计划如何补充国家当前的卫生和扶贫工作。
　　申请先经过秘书处筛查，然后转交技术审核小组根据公认的最佳惯例评估申请项目的技术水平连贯性。根据该审核程序，申请的项目可分为四大类：（1）有条件且适合接受援助；（2）经局部澄清后适合接受援助；（3）当前不适合接受援助，但建议修改和重新提交；和（4）不适合接受援助。然后理事会根据现有的资金，在考虑技术审核小组的建议后批准（1）类和（2）类申请。
　　尽管技术审核小组在第二轮采用的标准甚至比第一轮还要严格，审核小组认为，经过各国在准备申请阶段大量增加了投入，并常常伴以技术合作伙伴的重要贡献，项目申请的质量已获得了改善。  

　　建立一个简化、快速和创新的赠款程序，实行透明作业，切实负责。
　　虽然基于绩效的赠款理念并不是由全球基金提出的，全球基金开创了许多具有现实意义的体系来实施这一理念，平衡效率与责任的需要。这包括与受赠国家进行合作，确定一些用来衡量计划进展的重要指标，并确保全球基金尽可能地在现有程序的基础上汇报需求。
　　当地基金代理是另一责任机构，在尊重当地项目的实施过程时提供适当的监督。
有关全球基金的透明操作承诺，此网站上有详细的信息说明。所有批准的申请计划和签订的赠款协议都能查看到原始文件，例如理事会讨论的文件。
　　全球基金网站使用6种语言来公布信息：阿拉伯语、汉语、英语、法语、俄语和西班牙语，使全球基金的信息更为公开化。公众现在可以通过查看当前受赠人报告来跟踪地方计划的进展。